《黄帝内经》所说“正气存内，邪不可干”，认为疾病的发生是因为机体的正气不足，造成疾病的发生。正气不足主要表现在阴阳失调和气血、津液代谢失常。中兽医认为机体阴阳失和谓之病。

机体是一个整体，机体各器官功能和代谢随着机体消耗和能量转化处在不断变化的过程中，动态变化中的某个阶段、器官功能的太过或不及，会造成机体内代谢指标出现轻度偏差，体质好机体会自我调节正常，体质差机体会出现代谢障碍。

正常情况下机体面临两种适应能力。一种是机体内部变化（生长消耗、免疫应答）的调节能力即内适应能力。另一种是机体适应外部变化（通风管理、气候剧烈变化）的适应能力即外适应能力。 这两种适应能力都需要机体的正气去调节，机体的正气也可理解为体质或者说自我调节能力。机体疾病是由于机体内部适应力和环境变化产生六淫（对机体来说超过其适应能力变化如应激、饲料变化、环境温度湿度通风等）影响机体，导致机体不适，导致代谢障碍，继而继发感染致病微生物。机体不适在先，致病微生物繁殖感染在后，所以疾病的预防首先是调理机体的适应能力，改善体质。不是用抗生素杀灭微生物。