中医经典《内经》中提出：夫阴阳者，数之可十，推之可百，数之可千，推之可万，天地阴阳者，不可以数推，以象之谓也。这句话明确阐明了宇宙万物之间的联系，即通过事物表现出来的外部征象来探索事物内部规律，其核心便是“整体--平衡”理论。①整体。机体是一个复杂的整体，任何局部病变都和整体有着密切的联系，看待疾病是要从整体出发。②平衡。任何疾病的发生都是整体遭到破坏的结果，而平衡的不同环节遭到破坏会产生不同的症状。因此，我们要通过外在症状的分析和研究来判断体内平衡的破坏情况，从而掌握疾病的本质、把握疾病的转归。

机体是一个有机协调的整体，整体各部分之间既相互联系又相互制约，共同协调运转完成各项功能。中医所讲的各个脏腑不是单纯的某个脏器，而是某一系统的功能，如心脏是心系统，除了负责提供血液循环的动力外，还主神志，一切精神活动都与其有关；肝脏负责储藏血液和解毒，主疏泄，不再是西医所讲的肝脏。五脏之间存在着有规律可循的联系和制约关系，就是中医所讲的“五行相生”和“五行相克”。

西医探讨疾病发生的原因都是通过实验室检测得出某种细菌、病毒病，然而并不能得出为什么会产生病原菌，更无法得知病原菌和临床症状以及机体整体平衡的关系。举个简单的例子：一潭发黑发臭的死水，通过化验得出水中腐败菌繁殖过多，但如果就此认为潭水发黑发臭的根本原因是腐败菌那就大错特错，即便通过杀死腐败菌来治理污水也无济于事，因为潭水发黑发臭的根本原因是由于潭水失去了流动性，因此改善水质的本质方法是增加其流动性，潭水变死水，原本的生态平衡被破坏，这些变化为腐败菌的繁殖创造了条件。疾病亦是如此，机体自身的平衡状态被打破，为病原菌的繁殖创造条件，进而出现某种病菌过量繁殖的现在。治疗疾病的本质不仅仅是杀灭病原菌，更需要调节机体各功能，恢复其原有的平衡状态。

中医治疗疾病是探讨疾病发生的本质，是探讨机体的“整体--平衡”关系中的具体哪一环节发生变化，通过中药调理恢复其正常状态，进而实现疾病的好转。单纯地治疗病原菌只是暂时性地缓解症状，机体自身的机能尚未恢复，病情还会出现反复。因此治病要标本兼治，重视机体自身方能有效。